化学相容性是指两种物质相互接触时的和谐共轭作用。通过考虑一种物质与另一种物质混合时的稳定性来进行测量。在混合时，如果元素没有显示变化，则它们被认为是相容的，而如果物质发生物理或化学变化，则认为它们是化学不相容的。化学相容性是袋式过滤器过滤过程中很重要的因素。在过滤液体，气体或空气时，需要考虑过滤材料的成分。过滤器的材料应与被过滤液体的化学性质兼容。这样可以大大减少过程中发生故障的风险。通常观察到与液体有关的化学相容性，但有时候，溶解的溶质可能会不希望地与滤液介质混合。因此，应让过滤介质对某些物质有抵抗力。应注意不要因化学暴露而对介质造成损害。只有发现它们兼容，才可以继续进行过滤过程。
　　兼容性受不同因素影响，比如暴露时间长短，浓度，温度和施加的压力。这些因素单独地或组合地能够影响过滤过程。在袋式過濾器有機溶劑的情況下，这些因素很重要。过滤器的介质应耐溶剂，否则对过滤那些溶剂没有什么作用。同样，如果溶剂化学侵蚀过滤器，或者如果过滤器经历了化学降解，则它可能会将污垢元素释放到料流中，因此对于实际目的是无用的。
　　此外，某些溶剂不会破坏袋式过滤器，但会被聚合物基质吸收，因此会改变孔径并改变过滤器的性能以备将来使用，从而从长远来看会缩短其使用寿命和效率。在过滤水溶液的情况下，可能发生类似的情况。